Чаще всего в проекте кроме кода есть бинарные файлы. И вполне вероятна ситуация, когда слияние двух веток завершается конфликтом в одном (или нескольких) из них. Есть простой способ разрешить такой конфликт.
Если нам нужно оставить версию из текущей ветки, то следует выполнить такую команду:
git checkout --ours -- path/to/file.bin
А если нужно заменить файл на версию из сливаемой ветки, то такую команду:
git checkout --theirs -- path/to/file.bin
Естественно, замените path/to/file.bin на путь к конфликтному файлу.
Кстати, вместо вышеприведенных команд можно извлечь файл из любой ветки и/или правки, а так же просто скопировав «поверх» другую версию файла средствами операционной системы. После этих манипуляций надо добавить файл в индекс, чтобы git включил его в комит:
git add path/to/file.bin
После чего завершаем слияние комитом:
git commit

